Животные отправлялись за истёкший период года с территорий, подведомственных Управлению, по месту назначения в регионы: Московский, Красноярский, Нижегородский, Омский, Рязанский, Тамбовский, Новосибирский, Тульский, Тверской, Калужский, Пензенский и другие, а так же в Краснодарский край, Республику Чувашию и Республику Татарстан.Управлением Россельхознадзора по Владимирской, Костромской и Ивановской областям с начала 2022 года согласовано 257 маршрутов перевозки животных. Так, 135 маршрутов перевозки согласовано сотрудниками Управления в Костромской области, 70 – Владимирской, 52 – Ивановской. Наиболее часто для согласования маршрута обращаются владельцы свиней и крупного рогатого скота. Цирковые и зоопарковые, экзотические животные: тигры, львы, жирафы, ламы, верблюды, еноты, волки, филины, совы и другие, также нередко значатся в заявлениях для согласования.
Одной из главных задач согласования маршрута является эпизоотическая безопасность, в частности, предупреждение возникновения и распространения заразных болезней животных. Заявления для согласования маршрута в Управление Россельхознадзора поступают от юридических и физических лиц, индивидуальных предпринимателей. Специалисты отдела государственного ветеринарного надзора Управления осуществляют деятельность по согласованию маршрута перевозки животных в ФГИС «Цербер», учитывая при этом в обязательном порядке регионализацию территории Российской Федерации и оценивая условия перевозки на протяжении всего маршрута следования животных